La ville de Aracaju naquit au rivage de la Sergipe. Aracaju signifie «l’anacardier des perroquets», mot d’origine tupi composée par les éléments: ara = perroquet et acayú = fruit de l’anacardier. La ville fut construite pour abriter la capitale de la Province de Sergipe, qui jusqu’à ce moment-là était située en São Cristóvão. Le transfert se donna en 1855 sur l’initiative de ce qui était alors le président provincial Inácio Joaquim Barbosa, une fois que São Cristóvão n’arrivait pas à offrir les conditions indispensables à une région administrative. La ville au bord de mer, dominée par des marais et flaques facilitait, à l’époque, le transport du sucre. Le tracé urbain fut élaboré par une commission d’ingénieurs, ayant comme responsable Sebastião Basílio Pirro. Jusqu’alors, les villes s’adaptaient aux conditions topographiques naturelles, se fixant irrégulièrement sur le panorama urbain. L’ingénieur Pirro s’opposa à cette version et Aracaju fut l’une des premières villes du Brésil à avoir un projet de tendance géométrique. Sa conception se basa sur une réticule quadrillée, orthogonale, comme un «échiquier» et s’encastrait d’un esprit plus progressiste pour la nouvelle capitale, en contra-position à la vieille ville coloniale, São Cristóvão, avec ses rues sinueuses et spontanées.

• 1855 – Le président de la province Inácio Joaquim Barbosa transféra officiellement la capitale de São Cristóvão pour la commune de Santo Antônio do Aracaju, qui est située entre deux rivières – la Sergipe et la Vaza-Barris.
• 1857 – La première procession fluviale du Bom Jesus dos Navegantes est réalisée jusqu’à aujourd’hui au 1° janvier dans l’estuaire de la Sergipe.
• 1859 – Il existait déjà le cimetière São Benedito, selon atteste le tombeau de Felix Pereira de Azevedo.
• 1862 – Construction de l’église paroissiale Nossa Senhora da Conceição.
• 1864 – La résolution 568 de 4 janvier 1864 augmenta les limites de la ville.
• 1884 – Surgit la première fabrique de tissus, marquant le début du développement industriel.
• 1886 – Aracaju possédait alors une population de 1.484 habitants, ayant une presse officielle en plus de quelques lignes de bateaux à l’intérieur de l’état.
• 1900 – Commence le revêtement des rues avec des pierres régulières et sont exécutées des œuvres d’embellissement et d-aspas-assainissement.
• 1908 – Les trains de mulets arrivent à la ville. En cette année est inauguré le service de conduite d’eau par des tuyaux, ce qui était un luxe à l’époque.
• 1926 – Les trains de mulets sont remplacées par les tramways. C’était la modernité qui arrivait et Aracaju avait besoin d’adhérer aux nouvelles inventions.
• 1914 – Sont inaugurés les services des égouts sanitaires. À la même année arrive le chemin de fer. Construction de la Estrada Nova, qui plus tard fut dénommée avenue Independência et après fut rebaptisée avec le nom d’avenue João Ribeiro.
• 1949 – Implantation de la voie ferrée, insertion d’autoroutes et des automobiles.
• 1960 – Aracaju présente un certain déclin en ses activités portuaires et commence à avoir un rôle politique-administratif plus fort, avec un grand nombre de fonctionnaires qui soutiennent le commerce de la région centrale, en plus de présenter une tendance au développement des activités tertiaires.
• Décennies de 60 et 70 – La découverte du pétrole au littoral de Aracaju favorise le développement économique.
• 1963 – Aracaju entre dans un nouveau cycle de développement. La récente Petrobras arrivait à la ville après la découverte du pétrole au sous-sol et à la plateforme maritime.
• 1966 – Surgit le premier code d’urbanisation de Aracaju.
• 1977 – Fut créé l’EMSETUR – Empresa Sergipana de Turismo (entreprise de tourisme de Sergipe).
• Décennie de 80 – Le gouvernement réveilla pour la grande industrie et les œuvres d’infrastructure touristique commencent à être réalisées. Aracaju reçut des hôtels de haut niveau et eut le bord de la plage Atalaia construit, ce qui est, aujourd’hui, la plus importante carte postale de la ville. Des autoroutes furent implantées pour faciliter l’accès aux plages des littoraux au sud et au nord.
• 2000 – La ville de Aracaju contient une population de 461.534 habitants (IBGE, Recensement de l’année 2000).