Jardinópolis surgió de un pequeño pueblo, distrito de Batatais, en las proximidades del Rio Pardo. Su primer nombre fue Ilha Grande. En 1896, su nombre cambió para Jardinópolis, en un sencillo homenaje al precursor republicano Antônio Silva Jardim.
El primer alcalde de Jardinópolis, Dr. João Muniz Sapucaia, construyó, en su gestión, el Cementerio Municipal, pero viniendo éste a fallecer, él mismo lo inauguró.
Su población es originaria de inmigrantes italianos, sirio-libaneses, japoneses, portugueses y españoles. La mayoría de ellos fue a la ciudad, dedicándose principalmente a la industria del café y, posteriormente, al cultivo de la caña de azúcar. Los que no se dedicaban a la agricultura se establecieron principalmente en el comercio. Debido a la proximidad de los municipios más grandes, el proceso de desarrollo económico en Jardinópolis es lento.

• 1859 – Los colonos Joaquim José D-aspas-Araújo y su mujer, Doña Teodora de Jesús, Antônio Pereira da Silva y su esposa, Doña María Florencia de Jesús, donaron, respectivamente, 30 alqueires y 18 alqueires de tierras, en la hacienda Ilha Grande, para la construcción de una capilla en su patrimonio, en alabanza a la Virgen Aparecida. Se inició, así, la formación del pueblo, que recibió el nombre de Ilha Grande, en extensión al de la Hacienda que lo originó.
• 1886 – Instalación de la Estación de Hierro Visconde de Paranayba.
• 1890-1930 – Desarrollo de la producción de café.
• 1892 – El pueblo fue elevado a Distrito por la Ley Estatal número 115, de 01 de octubre de 1892, en el municipio de Batatais. Construcción del primer Cementerio de Jardinópolis, actual capilla de Santa Luzia. El terreno fue donado por José Pereira de Oliveira.
• 1894 – Instalación de la Estación de Hierro Sarandy, que conecta Jardinópolis a Francia.
• 1896 – Fue modificado el nombre del Distrito de Ilha Grande para Jardinópolis, por medio de la Ley Estatal número 484, de 24 de diciembre.
• 1898 – Jardinópolis fue elevada a la categoría de municipio por la Ley Estatal número 544, del 27 de julio, desmembrándose de Batatais.
• 1899 – El 18 de febrero fue creada la comarca, bajo la Ley Estatal número 5285.
• 1965 – El 22 de agosto ocurrió su instalación, siendo que hasta la presente fecha todos los asuntos jurídicos eran tratados en la comarca de Batatais, de quien fuera distrito.
• 1911 – El municipio fue constituido Distrito Sede.
• 1916 – Instalación del cruce de la Estación Mogiana: un camino seguía para Jaguar, en Minas Gerais, y el otro para Igarapava, en São Paulo.
• 1918 – Se creó el Distrito de Sarandy e se lo incorporó al municipio de Jardinópolis bajo la Ley número 1632, del 27 de diciembre.
• 1919 – Construcción del Cementerio Rural en el distrito de Sarandy, hoy Jurucê. Fue construido por Luís Vicentini y Antônio Vicentini. Las tierras eran de los Sres. Minto y Hermanos.
• 1933 – En división administrativa, el municipio de Jardinópolis figura con dos Distritos: Jardinópolis y Sarandy. 
• 1936-1937 – En las divisiones territoriales, así como en el cuadro adjunto al Decreto de la Ley Estatal número 9073, de 31 de marzo de 1938, el municipio de Jardinópolis pertenece judicialmente a Batatais, de la comarca de Batatais.
• 1960 – En división territorial, el municipio está constituido por dos distritos: Jardinópolis y Jurucê, así permaneciendo en la división territorial de 1999.
• 1990 – Considerada en la región como Terra da Manga (tierra de la manga).