Hay algunas hipótesis controvertidas acerca del origen del significado del nombre de la ciudad de Batatais. Una de las vertientes dice que ese origen se dio en función de las extensas plantaciones de patatas, hechas por los indios y descubiertas por los primeros habitantes. Otro aspecto atribuye el nombre al tupí, EMBOITATA (o Boitatá), que significa serpiente de fuego, que, en la creencia de los indios, era el “genio que protegía los campos contra incendios” (CARDOSO, 2001, p. 147). Estas definiciones son, sin embargo, demasiado frágiles.

Otra versión, que parece más consistente, considera que los términos “batatas” o “patatas” aparecen comúnmente en documentos setecentistas, refiriéndose no a plantaciones de patatas, sino a lugares en que se extrae oro, o incluso como método de extraérselo. En el marco de la controversia en torno al nombre de la ciudad, lo que se puede afirmar es que, el 5 de agosto de 1728, Antonio da Silva Caldeira Pimentel, Gobernador de la Capitanía de São Paulo, concedió una carta de sesmaría a Pedro Rocha Pimentel, situada en el “campo dos Batataes no Caminho dos Guayazes passando o mato da Corda no primeiro ribeiro entre o rio Pardo e o Sapucahy”.

Esta donación de sesmaría es, por así decir, el certificado de nacimiento de Batatais. El municipio sólo fue elevado a la categoría de ciudad en 1875. El Cementerio Senhor Bom Jesus, fundado en el siglo XIX, fue bautizado con el nombre del patrono de la ciudad. Fue construido en el período áureo de la producción de café en la región. Se apropió de tumbas de buena hechura artesanal, concordantes con el estilo ecléctico de la época, realizadas, en su mayoría, por personas que trabajan con mármol y eran oriundas de la inmigración italiana.

• 1726 – Fue oficializado el descubrimiento de oro en el sertão de Goiás por la bandera de Anhangüera II. Con ello, la región de los “Campos dos Batataes” se convierte en pasaje obligatorio para los nuevos entrantes y principal razón para las primeras ocupaciones.
• 1728 – Concesión de una sesmaría a Pedro da Rocha Pimentel en los “Campos dos Batataes”.
• 1810 – El campamento de entonces poseía un cementerio, cuatro chacras cercadas de tablas, con pastizales para los animales.
• 1815 – Campos dos Batataes fue elevado a la categoría de parroquia, creado en el Municipio de Mogi-Mirim. Pertenecía a la Comarca de Itu.
• 1821 – Autorización para el traslado de la sede de la parroquia a otra localidad. Se produjeron fuertes disputas entre los habitantes de la parroquia en torno al cambio o a la permanencia de la sede del campamento en las inmediaciones de la “Fazenda dos Batataes”.
• 1822 – Donación de la porción de tierras denominadas “Campo Lindo das Araras”, hecha por Germano Moreira y su esposa, Ana Luiza, para el patrimonio de la iglesia; quedando, por lo tanto, con dos núcleos urbanos, deshaciéndose el campamento viejo con el tiempo.
• 1839 – El municipio de Batatais fue elevado a la categoría de Vila.
• 1875 – La sede municipal fue elevada a la categoría de ciudad. Se instaló la comarca del municipio.
• 1886 – Según registros locales, ocurrieron en Batatais 304 nacimientos, 176 óbitos y 75 bodas.
• 1890 – Ya existía el Cementerio Senhor Bom Jesus de Batatais (Dec. 789, de 27 de septiembre de 1890, art. 2°, in fine, y art. 4º, párrafo único).
• 1911 – El Municipio se componía de los distritos de Batatais, Mato Grosso de Batatais y Brodósqui.
• 1938 – Los municipios de Batatais, Brodósqui y Jardinópolis constituían el único término judicial de la comarca de Batatais.
• 1994 – La ciudad de Batatais fue elevada a la condición de estancia turística.