Existem algumas hipóteses controvertidas acerca da origem do significado em torno do nome da cidade de Batatais. Um das vertentes diz que a origem do nome Batatais deu-se em função das extensas plantações de batatas, feitas pelos índios e descobertas pelos primeiros habitantes. Outra vertente atribui o nome ao tupi, EMBOITATA (ou Boitatá), que significa cobra de fogo, que na crença dos índios, era o “gênio que protegia os campos contra incêndios” (CARDOSO, 2001:147). Essas definições são, porém, por demais frágeis.
Outra versão, que parece mais consistente, considera que os termos “batatal” ou “batataes” aparecem comumente em documentos setecentistas, referindo-se não a plantações de batatas, mas a locais que se extraia ouro, ou mesmo como método de extraí-lo. Diante de tanta controvérsia em torno do nome da cidade, o que se pode afirmar é que em 05 de agosto de 1728, Antônio da Silva Caldeira Pimentel, Governador da capitania de São Paulo, concedeu carta de sesmaria a Pedro Rocha Pimentel, situada no “campo dos Batataes no Caminho dos Guayazes passando o mato da Corda no primeiro ribeiro entre o rio Pardo e o Sapucahy.”
Essa doação de sesmaria é, por assim dizer, a certidão de nascimento de Batatais. O município só foi elevado à categoria de cidade em 1875. O Cemitério Senhor Bom Jesus, fundado no século XIX, foi batizado com o nome do padroeiro da cidade. Ele foi construído no período áureo da monocultura cafeeira da região. Apropriou-se de túmulos de boa feitura artesanal, condizentes com o estilo eclético da época, realizados em sua maioria, por marmoristas oriundos da imigração italiana.

• 1726 – Foi oficializada a descoberta de ouro no sertão de Goiás pela bandeira de Anhangüera II. Com isso, a região dos “Campos dos Batataes” torna-se passagem obrigatória para os novos entrantes e principal razão para as primeiras ocupações.
• 1728 – Concessão de uma sesmaria a Pedro da Rocha Pimentel nos “Campos dos Batataes”.
• 1810 – O arraial de então possuía um cemitério, quatro chácaras cercadas de tábuas, com pastagens para os animais.
• 1815 – Campos dos Batataes foi elevado à categoria de freguesia, criado no Município de Mogi-Mirim. Pertencia à Comarca de Itu.
• 1821 – Autorização para a transferência da sede da freguesia para outra localidade. Houveram acirradas disputas entre os moradores da freguesia em torno da mudança ou da permanência da sede do arraial nas imediações da “Fazenda dos Batataes”.
• 1822 – Doação da porção de terras denominadas “Campo Lindo das Araras” feita por Germano Moreira e sua esposa Ana Luiza para patrimônio da igreja; ficando, portanto, com dois núcleos urbanos, desfazendo-se o arraial velho com o tempo.
• 1839 – O município de Batatais foi elevado à categoria de Vila.
• 1875 – A sede municipal foi elevada à categoria de cidade. Foi instalada a comarca do município.
• 1886 – Segundo registros locais, aconteceram em Batatais 304 nascimentos, 176 óbitos e 75 casamentos.
• 1890 – Já existia o Cemitério Senhor Bom Jesus de Batatais (Dec. 789 de 27 de setembro de 1890, art. 2°, in fine e art. 4° parágrafo único).
• 1911 – O Município se compunha dos distritos de Batatais, Mato Grosso de Batatais e Brodósqui.
• 1938 – Os municípios de Batatais, Brodósqui e Jardinópolis constituíam o único termo judiciário da comarca de Batatais.
• 1994 – A cidade de Batatais foi elevada à condição de estância turística.